MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28

Total Repeats: 490

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008568	CTCATA	2	12	344	355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621800
2	NC_008568	T	6	6	375	380	0 %	100 %	0 %	0 %	117621800
3	NC_008568	ATC	2	6	447	452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621800
4	NC_008568	TAC	2	6	468	473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621800
5	NC_008568	TAA	2	6	479	484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621800
6	NC_008568	TAT	2	6	704	709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621801
7	NC_008568	TTC	2	6	747	752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621801
8	NC_008568	TAA	2	6	773	778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621801
9	NC_008568	T	7	7	790	796	0 %	100 %	0 %	0 %	117621801
10	NC_008568	ATA	2	6	798	803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621801
11	NC_008568	TCTT	2	8	805	812	0 %	75 %	0 %	25 %	117621801
12	NC_008568	AT	3	6	891	896	50 %	50 %	0 %	0 %	117621801
13	NC_008568	TAT	2	6	1396	1401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621802
14	NC_008568	TA	3	6	1416	1421	50 %	50 %	0 %	0 %	117621802
15	NC_008568	TTTG	2	8	1523	1530	0 %	75 %	25 %	0 %	117621802
16	NC_008568	TTA	2	6	1570	1575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621802
17	NC_008568	TAA	2	6	1577	1582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621802
18	NC_008568	CAT	2	6	1583	1588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621802
19	NC_008568	TTC	2	6	1638	1643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621802
20	NC_008568	AGAT	2	8	1699	1706	50 %	25 %	25 %	0 %	117621803
21	NC_008568	ATA	2	6	1718	1723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621803
22	NC_008568	TCT	2	6	1867	1872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621803
23	NC_008568	T	6	6	1884	1889	0 %	100 %	0 %	0 %	117621803
24	NC_008568	TAA	2	6	1972	1977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621803
25	NC_008568	CA	3	6	1981	1986	50 %	0 %	0 %	50 %	117621803
26	NC_008568	AAT	2	6	1994	1999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621803
27	NC_008568	ATC	2	6	2081	2086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621803
28	NC_008568	TCT	2	6	2126	2131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117621803
29	NC_008568	CA	3	6	2147	2152	50 %	0 %	0 %	50 %	117621803
30	NC_008568	T	7	7	2169	2175	0 %	100 %	0 %	0 %	117621803
31	NC_008568	AGA	2	6	2267	2272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621803
32	NC_008568	T	7	7	2309	2315	0 %	100 %	0 %	0 %	117621803
33	NC_008568	T	7	7	2392	2398	0 %	100 %	0 %	0 %	117621803
34	NC_008568	A	6	6	4905	4910	100 %	0 %	0 %	0 %	117621804
35	NC_008568	ACA	2	6	4922	4927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621804
36	NC_008568	CTTT	2	8	4968	4975	0 %	75 %	0 %	25 %	117621804
37	NC_008568	AAAT	2	8	5010	5017	75 %	25 %	0 %	0 %	117621804
38	NC_008568	T	6	6	5033	5038	0 %	100 %	0 %	0 %	117621804
39	NC_008568	A	6	6	5060	5065	100 %	0 %	0 %	0 %	117621804
40	NC_008568	ATTACG	2	12	5184	5195	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	117621804
41	NC_008568	ACAAAA	2	12	5207	5218	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	117621804
42	NC_008568	A	6	6	5223	5228	100 %	0 %	0 %	0 %	117621804
43	NC_008568	AAT	2	6	5248	5253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621804
44	NC_008568	ACG	2	6	5274	5279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621804
45	NC_008568	AACAA	2	10	5280	5289	80 %	0 %	0 %	20 %	117621804
46	NC_008568	ACC	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621804
47	NC_008568	TAT	2	6	5309	5314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621804
48	NC_008568	GATA	2	8	5332	5339	50 %	25 %	25 %	0 %	117621804
49	NC_008568	A	6	6	5339	5344	100 %	0 %	0 %	0 %	117621804
50	NC_008568	GAA	2	6	5429	5434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621804
51	NC_008568	CAAAA	2	10	5493	5502	80 %	0 %	0 %	20 %	117621804
52	NC_008568	A	6	6	5528	5533	100 %	0 %	0 %	0 %	117621804
53	NC_008568	ATA	2	6	5544	5549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621804
54	NC_008568	AAG	2	6	5553	5558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621804
55	NC_008568	AT	3	6	6447	6452	50 %	50 %	0 %	0 %	117621805
56	NC_008568	AAAAT	2	10	6481	6490	80 %	20 %	0 %	0 %	117621805
57	NC_008568	ATTA	2	8	6513	6520	50 %	50 %	0 %	0 %	117621805
58	NC_008568	TCTA	2	8	6526	6533	25 %	50 %	0 %	25 %	117621805
59	NC_008568	AATC	2	8	6590	6597	50 %	25 %	0 %	25 %	117621805
60	NC_008568	AATG	2	8	6660	6667	50 %	25 %	25 %	0 %	117621805
61	NC_008568	TAA	2	6	6692	6697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621805
62	NC_008568	TCA	2	6	6720	6725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621805
63	NC_008568	AT	3	6	6731	6736	50 %	50 %	0 %	0 %	117621805
64	NC_008568	TAA	2	6	6779	6784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621805
65	NC_008568	T	7	7	6817	6823	0 %	100 %	0 %	0 %	117621805
66	NC_008568	TC	3	6	6836	6841	0 %	50 %	0 %	50 %	117621805
67	NC_008568	TAC	2	6	6905	6910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621805
68	NC_008568	ATA	2	6	6949	6954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621805
69	NC_008568	GAA	2	6	6990	6995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621805
70	NC_008568	GATT	2	8	7074	7081	25 %	50 %	25 %	0 %	117621805
71	NC_008568	CCA	2	6	7238	7243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621806
72	NC_008568	GTT	2	6	7245	7250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117621806
73	NC_008568	ATC	2	6	7267	7272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621806
74	NC_008568	TTA	2	6	7295	7300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621806
75	NC_008568	CAT	2	6	7314	7319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621806
76	NC_008568	TAT	2	6	7350	7355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621806
77	NC_008568	CAA	2	6	7368	7373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621806
78	NC_008568	AAT	2	6	7396	7401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621806
79	NC_008568	T	7	7	7427	7433	0 %	100 %	0 %	0 %	117621806
80	NC_008568	TAA	2	6	7487	7492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621806
81	NC_008568	AAAAT	2	10	7604	7613	80 %	20 %	0 %	0 %	117621806
82	NC_008568	T	6	6	7618	7623	0 %	100 %	0 %	0 %	117621806
83	NC_008568	T	6	6	7625	7630	0 %	100 %	0 %	0 %	117621806
84	NC_008568	AAT	2	6	7680	7685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621806
85	NC_008568	A	8	8	7763	7770	100 %	0 %	0 %	0 %	117621806
86	NC_008568	CATT	2	8	7803	7810	25 %	50 %	0 %	25 %	117621806
87	NC_008568	TA	3	6	8002	8007	50 %	50 %	0 %	0 %	117621807
88	NC_008568	ATT	2	6	8058	8063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621807
89	NC_008568	TACT	2	8	8066	8073	25 %	50 %	0 %	25 %	117621807
90	NC_008568	A	6	6	8078	8083	100 %	0 %	0 %	0 %	117621807
91	NC_008568	A	7	7	8085	8091	100 %	0 %	0 %	0 %	117621807
92	NC_008568	A	6	6	8137	8142	100 %	0 %	0 %	0 %	117621807
93	NC_008568	CAAA	2	8	8148	8155	75 %	0 %	0 %	25 %	117621807
94	NC_008568	ATT	2	6	8196	8201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621807
95	NC_008568	GAA	2	6	8289	8294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621807
96	NC_008568	ATG	2	6	8316	8321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621807
97	NC_008568	GATT	2	8	8339	8346	25 %	50 %	25 %	0 %	117621807
98	NC_008568	CAA	2	6	8357	8362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621807
99	NC_008568	AGAAA	2	10	8409	8418	80 %	0 %	20 %	0 %	117621807
100	NC_008568	TAT	2	6	8441	8446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621807
101	NC_008568	A	6	6	8447	8452	100 %	0 %	0 %	0 %	117621807
102	NC_008568	TAA	2	6	8453	8458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621807
103	NC_008568	AAC	2	6	8484	8489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621807
104	NC_008568	TTA	2	6	8505	8510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117621807
105	NC_008568	TAA	2	6	8519	8524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621807
106	NC_008568	T	6	6	8540	8545	0 %	100 %	0 %	0 %	117621807
107	NC_008568	CAA	2	6	8629	8634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621807
108	NC_008568	TAC	2	6	8641	8646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621807
109	NC_008568	GAA	2	6	8670	8675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621807
110	NC_008568	TCAAA	2	10	8691	8700	60 %	20 %	0 %	20 %	117621807
111	NC_008568	CAA	2	6	8711	8716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117621807
112	NC_008568	A	6	6	8722	8727	100 %	0 %	0 %	0 %	117621807
113	NC_008568	AGG	2	6	8771	8776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117621807
114	NC_008568	A	6	6	8800	8805	100 %	0 %	0 %	0 %	117621807
115	NC_008568	AGA	2	6	8912	8917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621807
116	NC_008568	A	8	8	8926	8933	100 %	0 %	0 %	0 %	117621807
117	NC_008568	AT	3	6	9189	9194	50 %	50 %	0 %	0 %	117621808
118	NC_008568	AGA	2	6	9196	9201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621808
119	NC_008568	A	6	6	9239	9244	100 %	0 %	0 %	0 %	117621808
120	NC_008568	AGA	2	6	9295	9300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621808
121	NC_008568	T	6	6	9313	9318	0 %	100 %	0 %	0 %	117621808
122	NC_008568	AGA	2	6	9329	9334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621808
123	NC_008568	AGCA	2	8	9384	9391	50 %	0 %	25 %	25 %	117621808
124	NC_008568	A	8	8	9391	9398	100 %	0 %	0 %	0 %	117621808
125	NC_008568	AT	3	6	9456	9461	50 %	50 %	0 %	0 %	117621808
126	NC_008568	GATAA	2	10	9613	9622	60 %	20 %	20 %	0 %	117621809
127	NC_008568	ATA	2	6	9625	9630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621809
128	NC_008568	AAT	2	6	9640	9645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621809
129	NC_008568	AGA	2	6	9678	9683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621809
130	NC_008568	A	7	7	9701	9707	100 %	0 %	0 %	0 %	117621809
131	NC_008568	A	8	8	9763	9770	100 %	0 %	0 %	0 %	117621809
132	NC_008568	AT	3	6	9871	9876	50 %	50 %	0 %	0 %	117621809
133	NC_008568	TAA	2	6	9885	9890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621809
134	NC_008568	A	6	6	9911	9916	100 %	0 %	0 %	0 %	117621809
135	NC_008568	ATCA	2	8	9918	9925	50 %	25 %	0 %	25 %	117621809
136	NC_008568	AT	3	6	9941	9946	50 %	50 %	0 %	0 %	117621809
137	NC_008568	TAA	2	6	9968	9973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117621809
138	NC_008568	AACTA	2	10	9975	9984	60 %	20 %	0 %	20 %	117621809
139	NC_008568	TA	3	6	10021	10026	50 %	50 %	0 %	0 %	117621809
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